MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502

Total Repeats: 69220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021838	CTTT	2	8	42	49	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021838	ATA	2	6	86	91	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021838	TA	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021838	TCG	2	6	109	114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021838	C	6	6	245	250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_021838	CAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021838	CTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021838	AT	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021838	CAA	3	9	397	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021838	TAA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021838	TA	3	6	638	643	50 %	50 %	0 %	0 %	525924642
12	NC_021838	AGT	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525924642
13	NC_021838	ATT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525924642
14	NC_021838	TCG	2	6	731	736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924642
15	NC_021838	TACA	2	8	739	746	50 %	25 %	0 %	25 %	525924642
16	NC_021838	GTT	2	6	792	797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924642
17	NC_021838	CAA	2	6	798	803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525924642
18	NC_021838	CAT	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525924642
19	NC_021838	TTG	2	6	890	895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924642
20	NC_021838	CTG	2	6	903	908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924642
21	NC_021838	TTC	2	6	931	936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525924642
22	NC_021838	CAGG	2	8	950	957	25 %	0 %	50 %	25 %	525924642
23	NC_021838	TAG	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525924642
24	NC_021838	TTGA	2	8	1096	1103	25 %	50 %	25 %	0 %	525924642
25	NC_021838	TTG	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924642
26	NC_021838	A	6	6	1189	1194	100 %	0 %	0 %	0 %	525924642
27	NC_021838	T	7	7	1221	1227	0 %	100 %	0 %	0 %	525924642
28	NC_021838	ATG	2	6	1262	1267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525924642
29	NC_021838	CTG	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924642
30	NC_021838	CAA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525924642
31	NC_021838	TA	3	6	1335	1340	50 %	50 %	0 %	0 %	525924642
32	NC_021838	CTTG	2	8	1344	1351	0 %	50 %	25 %	25 %	525924642
33	NC_021838	GAT	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525924642
34	NC_021838	TGG	2	6	1459	1464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525924642
35	NC_021838	AATT	2	8	1545	1552	50 %	50 %	0 %	0 %	525924642
36	NC_021838	CGC	2	6	1614	1619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525924642
37	NC_021838	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525924642
38	NC_021838	TCA	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525924642
39	NC_021838	TCT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525924642
40	NC_021838	TA	4	8	1811	1818	50 %	50 %	0 %	0 %	525924642
41	NC_021838	CTG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924642
42	NC_021838	CTG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924642
43	NC_021838	TCC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525924643
44	NC_021838	TAA	2	6	1985	1990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525924643
45	NC_021838	TTA	2	6	1992	1997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525924643
46	NC_021838	TGT	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924643
47	NC_021838	TAA	2	6	2026	2031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525924643
48	NC_021838	AGCTT	2	10	2079	2088	20 %	40 %	20 %	20 %	525924643
49	NC_021838	TTAA	2	8	2127	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	525924643
50	NC_021838	A	6	6	2172	2177	100 %	0 %	0 %	0 %	525924643
51	NC_021838	CCAC	2	8	2278	2285	25 %	0 %	0 %	75 %	525924643
52	NC_021838	AAT	2	6	2303	2308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525924643
53	NC_021838	AGC	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525924643
54	NC_021838	GTATT	2	10	2315	2324	20 %	60 %	20 %	0 %	525924643
55	NC_021838	TTTC	2	8	2359	2366	0 %	75 %	0 %	25 %	525924643
56	NC_021838	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924643
57	NC_021838	CTC	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525924643
58	NC_021838	TG	3	6	2513	2518	0 %	50 %	50 %	0 %	525924643
59	NC_021838	T	7	7	2566	2572	0 %	100 %	0 %	0 %	525924643
60	NC_021838	TGACT	2	10	2576	2585	20 %	40 %	20 %	20 %	525924643
61	NC_021838	T	6	6	2606	2611	0 %	100 %	0 %	0 %	525924643
62	NC_021838	TGC	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924643
63	NC_021838	TTAA	2	8	2714	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	525927162
64	NC_021838	TTA	2	6	2722	2727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525927162
65	NC_021838	GAT	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525927162
66	NC_021838	TC	3	6	2770	2775	0 %	50 %	0 %	50 %	525927162
67	NC_021838	TGTTCT	2	12	2857	2868	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525927162
68	NC_021838	TC	3	6	2938	2943	0 %	50 %	0 %	50 %	525927162
69	NC_021838	CTT	2	6	2957	2962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021838	T	6	6	2965	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021838	TA	3	6	2973	2978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021838	TAAT	2	8	3008	3015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021838	ATTT	2	8	3136	3143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021838	ATC	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021838	TAA	2	6	3167	3172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021838	T	7	7	3185	3191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021838	CCTT	2	8	3268	3275	0 %	50 %	0 %	50 %	525927163
78	NC_021838	TTC	2	6	3296	3301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927163
79	NC_021838	ATCA	2	8	3311	3318	50 %	25 %	0 %	25 %	525927163
80	NC_021838	CT	3	6	3351	3356	0 %	50 %	0 %	50 %	525927163
81	NC_021838	GAT	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525927163
82	NC_021838	TGA	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525927163
83	NC_021838	CAT	2	6	3400	3405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525927163
84	NC_021838	CTT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927163
85	NC_021838	AGC	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525927163
86	NC_021838	TTC	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927163
87	NC_021838	CGG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525927163
88	NC_021838	TAGT	2	8	3520	3527	25 %	50 %	25 %	0 %	525927163
89	NC_021838	T	7	7	3707	3713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021838	TTCC	2	8	3805	3812	0 %	50 %	0 %	50 %	525924644
91	NC_021838	TA	3	6	3863	3868	50 %	50 %	0 %	0 %	525924644
92	NC_021838	ATTA	2	8	3888	3895	50 %	50 %	0 %	0 %	525924644
93	NC_021838	ACGC	2	8	3921	3928	25 %	0 %	25 %	50 %	525924644
94	NC_021838	TGCCA	2	10	4011	4020	20 %	20 %	20 %	40 %	525924644
95	NC_021838	T	6	6	4053	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	525924644
96	NC_021838	AAT	2	6	4095	4100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525924644
97	NC_021838	AAT	2	6	4125	4130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525924644
98	NC_021838	TGA	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525927164
99	NC_021838	TTC	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927164
100	NC_021838	T	6	6	4364	4369	0 %	100 %	0 %	0 %	525927164
101	NC_021838	CTG	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525927164
102	NC_021838	AAT	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525924645
103	NC_021838	ATT	3	9	4537	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525924645
104	NC_021838	CGT	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924645
105	NC_021838	T	6	6	4690	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	525924645
106	NC_021838	CTG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924645
107	NC_021838	TAA	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525924645
108	NC_021838	TTG	2	6	4768	4773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525924645
109	NC_021838	CTG	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525924645
110	NC_021838	CTA	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525924645
111	NC_021838	TCA	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525924645
112	NC_021838	TCC	3	9	4898	4906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525927165
113	NC_021838	TCC	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525927165
114	NC_021838	CTT	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927165
115	NC_021838	ATC	2	6	4957	4962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525927165
116	NC_021838	TC	3	6	5050	5055	0 %	50 %	0 %	50 %	525927165
117	NC_021838	CCAT	2	8	5062	5069	25 %	25 %	0 %	50 %	525927165
118	NC_021838	TCA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525927165
119	NC_021838	CTT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927165
120	NC_021838	ATT	2	6	5144	5149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525927165
121	NC_021838	TCC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021838	TAATC	2	10	5292	5301	40 %	40 %	0 %	20 %	525927167
123	NC_021838	ATTG	2	8	5351	5358	25 %	50 %	25 %	0 %	525927167
124	NC_021838	ACC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525927167
125	NC_021838	A	6	6	5492	5497	100 %	0 %	0 %	0 %	525927167
126	NC_021838	CAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525927167
127	NC_021838	TAA	2	6	5575	5580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525927167
128	NC_021838	AACT	2	8	5609	5616	50 %	25 %	0 %	25 %	525927167
129	NC_021838	CGA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525927167
130	NC_021838	TAA	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525927167
131	NC_021838	CCA	2	6	5950	5955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525927168
132	NC_021838	TC	3	6	5999	6004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021838	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	525927169
134	NC_021838	TCC	3	9	6043	6051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525927169
135	NC_021838	TAAT	2	8	6085	6092	50 %	50 %	0 %	0 %	525927169
136	NC_021838	CG	3	6	6093	6098	0 %	0 %	50 %	50 %	525927169
137	NC_021838	TTC	2	6	6159	6164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927169
138	NC_021838	GTC	2	6	6187	6192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525927169
139	NC_021838	TGATT	2	10	6218	6227	20 %	60 %	20 %	0 %	525927169
140	NC_021838	T	6	6	6229	6234	0 %	100 %	0 %	0 %	525927169
141	NC_021838	GTA	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525927169
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148	NC_021838	GCC	2	6	6678	6683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525927170
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174	NC_021838	TTA	2	6	7793	7798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525927171
175	NC_021838	TCT	2	6	7825	7830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927171
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251	NC_021838	AT	3	6	10948	10953	50 %	50 %	0 %	0 %	525927173
252	NC_021838	T	6	6	10968	10973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021838	GC	3	6	11023	11028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
254	NC_021838	T	6	6	11043	11048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021838	TCG	2	6	11060	11065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_021838	ATC	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_021838	ATGA	2	8	11145	11152	50 %	25 %	25 %	0 %	525924648
258	NC_021838	CCT	2	6	11193	11198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525927174
259	NC_021838	TTC	2	6	11218	11223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525927174
260	NC_021838	TCTG	2	8	11271	11278	0 %	50 %	25 %	25 %	525927174
261	NC_021838	GTC	2	6	11308	11313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525927174
262	NC_021838	TTG	2	6	11370	11375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525927174
263	NC_021838	AAATTA	2	12	11385	11396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021838	TAATGC	2	12	11425	11436	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
265	NC_021838	GCT	2	6	11438	11443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_021838	GC	3	6	11485	11490	0 %	0 %	50 %	50 %	525927175
267	NC_021838	AAT	2	6	11499	11504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525927175
268	NC_021838	CTA	2	6	11522	11527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525927175
269	NC_021838	T	8	8	11570	11577	0 %	100 %	0 %	0 %	525927175
270	NC_021838	ATT	2	6	11619	11624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525927175
271	NC_021838	T	6	6	11644	11649	0 %	100 %	0 %	0 %	525927175
272	NC_021838	TTG	2	6	11753	11758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525927176
273	NC_021838	CGC	2	6	11807	11812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525927176
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